공단은 지자체에서 관리하던 경주 국립공원을 인수받아 2008년 1월 16일부터 관리하기 시작하였다. 체계적인 공원관리에 한계를 느낀 지자체는 2007년 경주 국립공원의 국가관리체계로의 전환을 요청하였고, 공단은 인수준비단을 구성하여 3개월에 걸친 인수절차를 마무리하고 인계·인수 서명식과 사무소 개소식을 개최하였다.