경주국립공원은 본래 지방자치단체에서 관리하였으나 2007년 경주시에서 국가 관리체계로 전환해 줄 것을 요청, 국립공원관리청에서 공원관리전문기관인 국립공원관리공단으로 이관하기로 결정하였다.
